Cisza nad trumną prezydenta przerodziła się w spór o miejsce jego spoczynku. Jak podał Tygodnik Zamojski powołując się na Radio Zet, głos w tej sprawie zabrała rodzina Marszałka Józefa Piłsudskiego. To w krypcie Józefa Piłsudskiego właśnie ma być pochowany prezydent Lech Kaczyński i jego małżonka Maria Kaczyńska (w jednym sarkofagu). Rodzina Marszałka sprzeciwiła się nowemu pomysłowi kard. Stanisława Dziwisza, który zaproponował, by na Wawelu stworzyć kryptę prezydencką i, obok Lecha i Marii Kaczyńskich, spoczął Ryszard Kaczorowski, ostatni prezydent RP na uchodźstwie.
Krypta prezydencka powstałaby w przedsionku krypty, w której znajduje się sarkofag Marszałka Piłsudskiego. Aby pomieścić w niej dwa sarkofagi, trzeba kryptę przebudować i – co wywołało największy sprzeciw – przesunąć sarkofag Marszałka Piłsudskiego.
Nie zgodziła się też na to rodzina prezydenta Ryszarda Kaczorowskiego. Uznała, że Wawel i tak już podzielił Polaków. Ciało ostatniego prezydenta na uchodźstwie spocznie w światyni Opatrzności Bożej w Warszawie – oświadczyła rodzina.
Jerzy Bukowski, prezes Ogólnopolskiej Federacji Piłsudczyków popiera stanowisko obu rodzin. Mówi, że rezygnacja z pochówku obu prezydentów w jednej krypcie pozwoli uniknąć niezręczności przesuwania sarkofagu Marszałka Józefa Piłsudskiego. Za:tygodnikzamojski.pl
Krypta Marszałka Józefa Piłsudskiego pod Wieżą Srebrnych Dzwonów. Katedra na Wawelu. Sarkofag Lecha i Marii Kaczyńskich zostanie ustawiony w pierwszej komorze po lewej stronie.